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Zellkultur PDF
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• Zellkulturtechnik
• Primärkulturen
• Stabile Zellinien
• Transfektion
• Reporterzellen
• Zelldifferenzierung
• Induzierte Genexpression
• RNAi
Zellkulturtechnik
Primärzellen Zelllinien
Kardiomyozyten
• Suspensionskulturen
– washsen frei im Medium
– z.B.:
• Jurkat T-cell Leukämie Zellen
• BL28 Burkitt's Lymphoma Zellen
• Adhärente Zellen
– heften sich, in der Regel als Monolayerkulturen, an ein Substrat
(Kulturgefäß)
– z.B..
• HeLa (siehe unten)
• CHO – chinese hamster ovary cells
• HEK293 – human embryonic kidney cells
• SH-SY5Y – Neuroblastoma Zellen
Passagieren von adhärenten Zellen
• Zelladhäsion
• Ablösen der Zellen mittels
Trypsin und EDTA
HeLa
• Ca2+-DNA Präzipitat
• Chemische Transfektion – Transfektionsreagenzien
• Virale Transfektion
• Elektroporation
Transfektion mittels Transfektionsreagenzien
Kationische Lipide
Virale Transfektionssysteme
(Beispiele)
Elektroporation
Promotorsysteme
Beispiele für
verwendete
Promotoren
Reporterzellen
Fluorescent reporter
cell lines to monitor
mitotic exit in live
human cells. As a
reference marker for
chromatin, core
histone 2B-mRFP was
expressed in all cell
lines. Markers for
additional cellular
structures or tagged
mitotic regulators were
co-expressed as
indicated.
z.B.: Messung der Promotoraktivtät eines
bestimmten Gens mittels Luciferase
Zelldifferenzierung
Differentiation of PC-12
cells attached to culture
dishes coated with PEI.
PC-12 cells attached to
PEI coated dishes
remained firmly anchored
to the plate and extended
neurites upon treatment
with NGF. The pictures
show the progress of the
differentiation of the
treated cells over time: 0 h
(panel A), 24 h (panel B),
48 h (panel C) and 96 h
(panel D) after the initiation
of treatment with 100 ng/ml
of NGF. Vancha et al.
BMC Biotechnology 2004
z.B.: Differenzierung von SH-SY5Y Neuroblastoma
Zellen in einen (dopaminergen) Neuronenphänotyp
durch retinoic acid
• Transfektionseffizienz
• siRNA Design – die Grundlagen der Effizienz verschiedener
siRNA Target-Seqeuenzen in der mRNA Sequenz ist nicht
einmal im Ansatz verstanden. Alle verfügbaren Designhilfen
basieren auf empirischen Daten. “Try and error!”
• Viele Kontrollen sind notwendig um unspezifische Effekte der
Transfektion und der RNAi Maschinerie auszuschließen.
Letztere treten vor allem bei hohen siRNA Konzentrationen auf
(sequenzähnliche Targets sowie unspezifische antivirale
Antworten).
Ein Beispiel ...
siRNA Design
|1 10 20 30 40 50
exon2 [···:····|····:····|····:····|····:····|····:····|·
atggagagcaatacatcatcatctttggagaatttagcgacggcgcctgtg
M E S N T S S S L E N L A T A P V
TS1
60 70 80 90 100 110
exon3 ···:····|··][:····|····:····|····:····|····:····|····:····|·
aaccagatccaagaaacaatttctgataattgtgtggtgattttctcaaaaacatcctgt
N Q I Q E T I S D N C V V I F S K T S C
120 130 140 150 160 170
···:····|····:····|····:····|····:····|····:····|····:····|·
tcttactgtacaatggcaaaaaagcttttccatgacatgaatgttaactataaagtggtg TS15
S Y C T M A K K L F H D M N V N Y K V V
180 190 200 210 220 230
···:····|····:····|····:····|····:····|····:····|····:····|·
gaactggacctgcttgaatatggaaaccagttccaagatgctctttacaaaatgactggt
E L D L L E Y G N Q F Q D A L Y K M T G
240 250 260 270 280 290
exon4 ···:····][···:····|····:····|····:····|····:····|····:····|·
gaaagaactgttccaagaatatttgtcaatggtacttttattggaggtgcaactgacact TS28
E R T V P R I F V N G T F I G G A T D T
300 310 320 330 340 350
···:····|····:····|····:····|····:····|····:····|····:····|·
cataggcttcacaaagaaggaaaattgctcccactagttcatcagtgttatttaaaaaaa
H R L H K E G K L L P L V H Q C Y L K K
360 370
···:····|····:····|····:
Silencing der Expression des humanen Grx2
Lillig, C.H., Lönn, M.E., Enoksson, M., Potamitou Fernandes, A., and Holmgren, A.
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 13227-13232 (2004)
Phänotyp der Grx2-depletierten Zellen
Lillig, C.H., Lönn, M.E., Enoksson, M., Potamitou Fernandes, A., and Holmgren, A.
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 13227-13232 (2004)
Literatur