Beruflich Dokumente
Kultur Dokumente
ZELLE:
Laborgrundlagen ( 11.4.2012)
Lsungen:
Allgemeines:
Lsungsmittel (Solvens) meistens Wasser oder ein Puffer ( Puffer ist ein Gemisch aus
mehreren Substanzen) / zu lsende Substanz (Solut)
PH- Wert:
o
pH > 7 = basische
Stoffmenge n in mol:
o
Quantitative SI-Basisgre
n=
n= cV
m= Masse in g
M= Molare Masse in
Molare Masse M in
o
Summe der Masse aller Atome im Molekl bezogen auf 1 mol Stoffmenge
M=
m= Masse in g
n= Stoffmenge in mol
!
!
!
Konzentration c in :
o
Stoffmengenkonzentration: c=
in
c=
Puffer:
Verwendung
o
Bsp.: Carbonat-Puffer stabilisiert den pH-Wertes von Blut auf 7,35 7,45
Henderson-Hasselbach-Gleichung
o
pH = pK + log ()
Ermglicht die Berechnung des Pufferkapazitt und die Ermittlung des pHWertes (ber die analytisch bestimmbaren Konzentrationen von Salz und
Sure und den messbaren pK-Wert), Bei gleicher Konzentration an Salz und
Sure, gilt pH=pK
Kenngre / Pufferkapazitt : =
Puffersystem hat die Kapazitt = 1, wenn sich bei Zugabe von 1 mol
HO bzw. OH Ionen zu 1 Liter Pufferlsung der pH-Wert um eine
Einheit ndert
Biologische Puffer:
!
Zentrifugieren:
Trennung einer Substanz aus einer Suspension (heterogenes Stoffgemisch bis zur
Sttigungsgrenze gelst ) in einem Zentifugalkraftfeld
o
Trennung von Lsungen ( Bsp.: Trennung von Blut in seine Bestandteile ->
Auftrennung nach unterschiedlicher Sedimentationsgeschwindigkeit)
/ : 10
/ x 0,03
c=
c= ! c= ! c= = 0,05 M
n= cV
!
Proteinaufreinigung und Bestimmung (18.4.2012)
Hintergrund:
!
!
!
!
!
oGelfiltration : Auftrennung nach Gre
!
!
!
!
!
oAffinittschromatographie:
Bindung von Proteinen an bestimmte Komponenten in
der Trennungssule -> Methode aus dem Praktikum
Ziel: His p97 aus dem Zellextrakt zu gewinnen
indem man dessen hohe Affinitt zu Ni ausnutzt,
welches in der Waschsule gebunden vorliegt
Wegwaschen der ungebundenen Proteine
Elution durch Imidazol, da dieses mit dem His-p97
um die Bindung mit dem Ni konkurriert
Die Ausbeute und die Anreicherung werden anschlieend durch
Proteinbestimmung und SDS-Gelelektrophorese geprft
!
!
!
!
Proteinbestimmung nach Bradford:
Bio-Rad Protein Assay basiert auf dem Farbumschlag ( 465 nm nach 595 nm ) nach
Bindung des Farbstoffes Coomassie-Brilliant-Blau G-250 an die basischen und
aromatischen Seitenketten ( vor allem Arginin)
Deshalb kann die Zunahme der Absorption bei 595 nm durch die Bildung des
Komplexes gegen das freie Farbreagenz photometrisch gemessen werden
Strke der Farbreaktion hngt jedoch von Protein ab und ist sehr stranfllig
Zweck:
o
Immunisierung
Kulturberstnde
Heterologe Expression:
Expressionssysteme:
Bakterien
Hefe
Insektenzellen
Sugetierzellen
Giftigkeit (Zelltod)
Post-translationale Modifikation
Menge, Ausbeute
!
Bakterien
Hefe
Insekten
Sugetiere
Vermehrung
Schnell
Schnell
Langsam
Langsam
Zellkultur
Einfach
Einfach
Mig
Komplex
Kosten
Gering
Gering
Mig
Hoch
Expressionsgeschwind Schnell
igkeit
Langsam
Schnell
Langsam Schnell
Mig
Faltung
Mig
Gut
Exzellent
Schlecht
Elektrophorese (25.4.2012)
Definition:
Auftrennung erfolgt nach Gre und Ladung / Das Gel dient als Sieb
o
DNA / RNA
Proteine
Verfahren:
Agarose(gelelektrophorese )
o
Dient als interne Matrix, in der DNA- Molekle in einem elektrischen Feld
wandern
Kettenlnge [kb]
0,6
1- 20
1,5
0,3 - 6
DNA Aufbau:
Agarosekonzentration
Linearisierte DNA
!
!
Native Gelelektrophorese
o
!
!
o
Vor- und
Nachteile
nativen Gelelektrophorese
der
Vorteil:
!
!
Nachteil
Prinzip:
Grundlagen:
Laufpuffer: TRIS/Glycin
pH:8,8
Zwischen den Lauffronten des Leitions (Chlorid) und des Folgeions (Glycin) bilden
sich wegen der Potentialdifferenz Proteinstapel (blau) -> wandern gleich schnell
Glycin liegt negativ geladen vor (Glycinat) -> wandert schneller = Potentialdifferenz
hebt sich auf
Kleinere Poren: Proteinstapel verdichten sich -> werden nach Gre aufgetrennt
Nachweisgrenze: 100 ng
Silberfrbung
Nachweisgrenze: < 10 ng
Indirekter Nachweis:
Western-Blot
Protein wird auf eine Membran bertragen und mittels
spezieller Antikrper detektiert
Grundlage fr Proteom-Analysen
1. Dimension
2. Dimension:
!
Praktikumsskript : Rechenbungen:
Wie viel NaCl mssen sie einwiegen, um 250 L einer Lsung der Konzentration 1
herzustellen?
o
V= 250 L ! 0,25ml
p= 1
m= pV = 0,25ml 1
= 0,25 mg
Merksatz: (Volumen)
25 ml = 0,025 ml ! 25 L
Wie viel Gramm NaCl brauchen Sie, um 250 ml einer 1,16%igen Kochsalzlsung
herzustellen?
o
o
o
in
x ml = 1,16 %
= 2,9 g
Man bentigt 2,9 g
Sie haben eine 20%ige und eine 36%ige SDS-Lsung. Wie viel ml jder Lsung braucht
man, um einen Liter einer 30%igen SDS-Lsung herzustellen?
o
Mischungsdreieck:
20%
36%
30%
6
10
= 16 Teile bentigt
man insgesamt
!
!
!
!
!
!
!
10 Teile der 36%ign Lsung von einem Liter Liter = 0,625 L ! 625 ml
!
!
!
!
!
PCR (2.5.2012)
DNA-Aufbau:
Doppelhelix
Replikation
! Topoisomerase entspiralisieren den DNA- Doppelstrang
! Helicasen trennen die Wasserstoffbrckenbindungen zwischen den Basenpaaren
! aufgespaltener Bereich = Replikationsgabel
! Strang in 5-3 Richtung: nicht codogener Strang: DNA Polymerase verknpft die
komplementren Nukleotide an den vorhandenen RNA-Primer und verknpft sie zu einem
Einzelstrang ( Kontinuierlicher Strang in (3-5 Richtung)
! Strang in 3-5 Richtung: codogener Strang: RNA Primer mssen von der Primerase immer neu
gebildet werden, da der Strang Diskontunierlich gebildet werden muss ( in 5-3 Richtung). Die
DNA Polymerase bildet nun wieder die komplementren Nukleotide. Die Primer werden spter
durch die DNA Polymerase durch Nukleotide ersetzt. Die Lcken die entstanden sind werden von
DNA Ligasen geschlossen
3 Phasen Zyklen
o
Ausreichende Elongationszeit
Abschlieende Elongation
o
Sorgfltiges Arbeiten
o
%
Bestandteile einer PCR:
Plasmid-DNA
Genomische DNA
PCR-Fragmente
Zellmaterial
Meist 18-28 bp
Nicht selbstkomplementr
Thermostabile DNA-Polymerase
o
Puffer
o
MgCl / MgSO
o
HO:
o
PCR-Ansatz im Kurs:
!
!
Anwendungsaufgaben:
Klonierung, Sequenzierung
Genexpressionsuntersuchung
o
Medizinischer Diagnostik
o
Methoden:
PCR zu Klonierungszwecken
o
Megaprime-PRC
o
PCR zu Mutantenherstellung
o
!
!
Kolonie PCR
o
Zellaufschluss ( Mikrowelle)
Nested PCR
o
! Minimierung unspezifischer
Fragmente
Inverse PCR
o
Voraussetzungen:
Reverse Transkriptase
o
!
!
!
!
!
!
!
!
Quantitative PCR
!
!
!
!
!
!
Wichtig:
Multiplex-PCR
o
Mehrere Primerpaare in
einem Ansatz
!
!
Blotting (9.5.2012)
bersicht:
- berblick:
Elektrophoretisch aufgetrennte Proben von DNA, RNA oder Proteinen werden von
einem Gel auf eine Membran transferiert und dort irreversibel fixiert
( immobilisiert)
- Membranen:
Nitrocellulosefilter (NC)
Proteine binden auch jedoch nicht kovalent und nur ein kleiner
Anteil des Proteins bleibt haften. Kleinere Proteine wandern durch
die Membran
Reifest
Neutrale/geladene Membranen
Hohe Bindungskapazitt
Mehrfache Verwendung
!
o
Ionenaustauschermembranen
- Transfer:
Transferpuffer
o
Diffusionsblotting:
o
Allseitiger Vorgang: 2. Membran unter das Gel legen ! man erhlt einen
gespiegelten Transfer
Kapillarblotting
o
Membran
o
Verschiedene Anordnung:
Vakuumblotting / berdruckblotting:
o
Modifizierung Kapillarblotting
Druck=treibende Kraft
Unter- oder berdruck wird erzeugt der den Transferpuffer und die
Molekle durch das Gel auf die Membran treiben
Vorteil:
Nachteil:
Verfahren:
Tankblotting:
Hohe Stromstrke
Starke Erwrmung
rascher Pufferabbau
Semidry-Verfahren:
Geringere Erwrmung
!
- Blockierung:
Von Nukleinsuren:
o
Denhardts Puffer
Von Proteinen :
o
Mehrere Mglichkeiten :
2 % - 10 % BSA
% Gelatine
Frbemethoden:
Amidoschwarz,
Coomassie-Brilliantblau
irreversibel
Frbelsung stabil
Keine Hintergrundfrbung
Indian-Ink- Methode
irreversibel
Ponceau S
o
Fast Green
o
Silber Frbung
o
Hohe Empfindlichkeit
Direkt visualisierbar
Nicht radioaktiv
Silber-Frbung
o
Hohe Empfindlichkeit
fluoreszensassoziierte Systeme
o
indirekt visualisierbar
nicht radioaktiv
Lumineszenz
o
Indirekt visualisierbar
Nicht radioaktiv
Aequorin
Phenanthrolin-Komplexe
(Licht-)
Direkte/indirekte Systeme
Direkt:
Direkte Immundetektion:
Hybridisierung:
!
!
Indirekt:
Indirekte Reportersysteme:
o
DIG / Anti-DIG-Systeme
Bio/Avidin-Systeme:
Southern Blot
DNA
o
5. Kovalente Bindung der DNA an die Membran durch Hitze oder UV-Licht
!
!
Northern Blot
RNA
Methode zur Untersuchung der Genexpression anhand des Nachweises von RNA
Kovalente Bindung
Western Blot
Proteine
PVDF-Membran:
Hohe Proteinbindungskapazitt
Physikalische Beanspruchung
Chemische Stabilitt
Nitrocellulose-Membran
Blot-Puffer:
o
Enthlt Methanol :
Sorgt fr Khlung
Ablauf:
o
Elektrophoretischer Transfer der Proteine aus dem Gel auf eine Membran
Puffergefllte Kammer
Draht-Elektrode
Nachteil:
Vorteil:
o
Semidry:
Platten Elektrode
Nachteil
o
Vorteil:
o
Geringere Puffermenge
Geringer Pufferverbrauch
Antikrper-Inkubation
Direkt:
Vorteil:
o
Schnell
Indirekt:
Vorteil:
Nachteil:
Nachteil:
o
Aufwendiger + zeitintensiver
Antikrper-Detektion:
Gnstiger
Leicht zu produzieren
Gekoppelt mit
Peroxidase (HRP)
Radioaktiver Markierung
Fluorophor
Kolorimetrisch
Chemilumineszent
Radioaktiv
Fluoreszent
Kolorimetrisch:
Chemilumineszent:
Bsp.: Peroxidase
Mittels Rntgenfilm
Radioaktiv:
Fluoreszent:
NMR (16.5.2012)
Grundlagen:
Aminosuren:
o
Aufbau
Aminogruppe : HN
Apolare Seitenketten
Glycin (Gly , G)
Alanin (Ala, A)
Valin (Val , V)
Leucin (Leu, L)
Isoleucin (Ile, I )
Methionin ( Met, M)
Prolin (Pro, P)
Phenylalanin (Phe, F)
Tryptophan (Trp, W)
Polar, ungeladen
Tyrosin (Tyr , Y)
Serin ( Ser, S)
Threonin ( Thr, T)
Cystein (Cys, C)
Asparagin (Asn, N)
Glutamin (Gln, Q)
Aspartat (Asp, D)
Glutamat (Glu, E)
Lysin ( Lys, K)
Arginin (Arg, R)
Histidin (His, H)
Peptid-Bindung:
o
o
o
Hexapeptid:
o
Sekundrstruktur:
Tertirstruktur:
Wasserstoffbrckenbindungen ( H-Brcken)
Hydrophobe Wechselwirkungen
Ionenbindung
NMR-Spektroskopie :
Zweck:
o
Man bentigt die Abstnde zwischen den Protonen der Aminosuren der
Peptidkette
NMR- Spektren:
o
Tabelle:
Regeln:
1. Ausgehend von HA/NH Signal sucht man nach links/rechts im Spektrum nach
reinem NOESY Signal danach nach oben /unten nach dem nchsten HA/NH Signal,
dann bewegt man sich in Richtung C-Terminus ( !)
2. Ausgehend von HA/NH Signal sucht man oben /unten im Spektrum nach einem
reinen NOESY-Signal danach nach links/rechts zu dem nchsten HA/NH Signal, dann
bewegt man sich in Richtung N-Terminus ( )
Praktikum:
"
!
Photometrie ( 23.5.2012)
Licht: Elektromagnetische Wellen
Wie viel Licht absorbiert wird hngt von der Substanz und der Anzahl der
bestrahlten Molekle ab
Laporte-Regeln:
Bsp.:
Verboten : bergang 3s ! 4s
erlaubt : bergang 3s ! 3p/4p
Verboten: bergang gerade ! gerade (Orbital)
Bauweise Spektralphotometer:
%
Lambert-Beersche Gesetz:
E () = -lg () = ( ) c d
o
I = Ie*
Umformung:
Aus * wird :
-ln(
)= *cd
= lg(e) * 0,434 *
!
!
!
!
!
L-LDH aus Kaninchenmuskel:
Katalysierte Reaktion
Photometrische Aktivittsbestimmung:
Temperatur: RT
Wellenlnge : 340nm
Assay-Zusammensetzung:
o
7,5 l Probe
Indikatorreaktion:
Kaninchenmuskel
Photometrische Aktivittsbestimmung
Temperatur: RT
Wellenlnge : 366 nm
Assay Zusammensetzung:
75 l GAP-Lsung (0,1M)
5 l Probe
Brandford-Test:
Durch die Komplexbildung mit einem Protein wird der Farbstoff in seiner blauen,
unprotonierten, anionischen Form stabilisiert und das Absorptionsspektrum
verschiebt sich auf 595 nm
Extinktionskoeffiezient des Komplexes ist hher als der des freien Farbstoffes !
Absorption kann mit hoher Empfindsamkeit gegen die es freien Farbreagenz
photometrisch gemessen werden und ist ein Ma fr die Proteinkonzentration der
Lsung
!
Kalibrierungskurve: Absorption bei 595nm gegen die Konzentration c(BSA) in [g/ml]
"
Zhlkammer nach Thoma:
"
ORGANISMUS:
Schnitt- und Frbemethoden von Geweben ( 30.5.2012)
Was ist Histologie:
Mikroskopische Anatomie
Zweck:
Medizinische Diagnostik
Pathologie
Gerichtsmedizin
Grundlagenforschung
!
Ablauf:
Fixiermethoden:
2 Methoden:
Immersionsfixierung:
o
Perfusionsfixierung:
o
Fixierungsmittel:
Nachteil:
Glutaraldehyd
o
Alkohol
o
Permeablisiert Membranen
Nachteil:
Nachteil:
!
!
o
Einbettung
Anforderung:
Einbettungsmedien:
Parafin
o
Nachteil:
Kunstharz ( Methacrylat)
o
Nachteil:
Spezialmesser ntig
Gelatine
o
Wasserlslich
Nachteil:
Alternativ: Kryomikroskopie
o
Kein Wasserentzug
Nachteil:
Schneiden
Schnittdicke : 1-60 m
Einbettungsmedium: Parafin
Ultramikrotom:
o
Einbettungsmedium: Kunstharz
Kryomikrotom:
o
Schnittdicke: 5 100 m
Fr Gefrierschnitte
Eindecken
Verhindert Austrocknung
Entwsserte Prparate:
Wasserhaltige Prparate:
Frbemethoden
o
Frbemethoden:
Chemische Frbungen
Progressive Frbung:
Simultanfrbung:
Succedanfrbung:
Regressive Frbung:
Physiko-chemische Frbung:
Endpunktfrbung:
!
!
o
Hmatoxylin-Eosin-Frbung
Hmatoxylin
o
Eosin:
o
Eosin Y- Eosin G
Wasserlsliches Eosin
Eosin S
Hohe Lichtbestndigkeit
!
!
!
!
!
!
!
o
Toluidinblau Frbung
Basischer Thioninfarbstoff
Metachromasie:
Zellkerne blau
---
Cytoplasma violett
Zweck:
Fab :
variabler Teil
2 Antigenbindungsstellen
Konstanter Teil
Fc:
bentigt 2 Antikrper
Avidin:
Vorteil:
o
!
!
!
Molekularbiologische Nachweismethoden
o
In situ Hybridisierung:
Zweck:
Prinzip:
o
radioaktiv
Radioaktive Markierung:
Nichtradioaktive Markierung:
Biotin
Digoxigenin
Fluoreszenz
!
!
!
!
!
!
!
Praktischer Teil:
!
!
!
!
!
Verhaltensbeobachtungen (6.6.2012)
Kontrolle und Ausbung von Bewegungen oder Signalen, mit denen ein
Organismus mit Artgenossen oder anderen Komponenten seine belebten und
unbelbten Welt interagiert
Proximate Mechanismen
(Erklrung
gesteuert?
Explikative Ethologie
Deskriptive Ethologie
(Beschreibend)
Ultimate Funktion
1. Wie verhlt sich das Tier und wie wird sein Verhalten gesteuert?
Objektivitt durch:
Systematische Datenaufnahme
Objektive Auswertung
Hypothese
Versuchsweise Erklrungen
Voraussetzung:
o
Recherchen
Geduld, Zeit
Theorie:
!
Probleme/ berlegungen:
Opel- Field-Test
Markierung
Telemetrie
Natrliche Identifizierungsmerkmale
Ethogramm = Verhaltensrepertoire
Katalogisierung/ Gruppierung
Routine:
o
Sozialverhalten:
o
Hilfsmittel:
Einfache Hilfsmittel
Technik
o
!
Messgren:
Latenzzeiten
Dauern
Hufigkeiten
Kontinuierliche Datenregistrierung
Intervall-strukturierte Registrierung
o
Momentregistrierung
One-zero sampling
Ad libitum Registrierung
Gruppenbeobachtung
F=Fressen
o
Fokustierbeobachtung
Beobachtungsanalyse
Black-Box System
o
Zeitlicher Zusammenhang
Problem: Korrelation
Vergleichende Ethologie:
Analogie x Homologie
Konvergenz x Divergenz
Phylogenische Analyse
Experimentelle Ethologie:
Manipulation
Attrappen
Labyrinthe
Spontanes Verhalten
o
Wahlprferenzen
Induziertes Verhalten
o
Lernen
Verhaltensphysiologie:
Stoffwechselphysiologie
o
O - Verbrauch, EKG
L= Laufen, R= Ruhen,
Ethoendokrinologie:
Jahreszeitliche Uterscheide
Paarungsverhalten
Stress
Mulle:
Systematik:
o
Ordnung: Rodentia
Unterordnung: Hystricognatha
Gattung:
Strandgrber ( Bathyergus)
Blessmulle ( Georhychus)
Erdbohrer ( Heliophobius)
Nacktmulle ( Heterocephalus)
Reproduktive Arbeitsteilung
Visuelle Fhigkeiten
Potenzielle Faktoren
Dominanzverhalten?
Ruhemetabolismus ( Sauerstoffverbrauch) ?
Telomerverkrzung?
!
!
!
!
!
!
!
!
KOSYSTEM:
Fisch (13.6.2012)
Parasiten
Vorteile:
Nachteile:
Sauerstoffarmes Milieu
Verdauungsenzyme
Extremer pH-Wert
Hohe Osmolaritt
Strmung
Partnerfindung schwierig
Lebenszyklen:
Begiffe:
Wirt:
o
Endwirt:
o
Zwischenwirt:
o
Paratenischer Wirt:
o
Keine Entwicklung
Vektor:
o
Fakten:
Parasiten im Fisch:
Plathelminthes ( Plattenwrmer)
o
Viele Endoparasiten
Klassen:
Turbellaria:
Ruberisch
Trematoda:
Endoparasit
Meist 2 Saugnpfe
Dorsoventral abgeflacht
Komplizierte Zyklen
Monogenea:
Haftapparat : Haken
Cestoda:
Endoparasit
Rel. Gro
Haftorgane am Kopf
Acanthocephale ( Kratzwrmer)
Eine cm lang
Gelblich
Nematoden ( Fadenwrmer)
Meist drehrund
Unsegmentiert
Parasitische Crustacea:
Karpfenlaus
!
!
Praktikum:
Blut untersuchen
o
Trypanosomen
Fischart bestimmen
o
Altersbestimmung:
Bis 5 cm gro
Zwei Saugnpfe
Zwei Augenpaare
Segmentiert
Annelida ( Ringelwrmer)
Einige Millimeter
Crustacea (Krebstiere)
Hufeisenfrmiger Makronucleus
2. Hautabstrich
Mikroskopische Untersuchung
Trichodina spec.
o
Ufofrmiges Aussehen
Ciliat ( Wimperntierchen)
Ichthyobodo ncator
o
Flagellat (Geieltierchen)
Makroskopische Untersuchung
Gyrodactylus spec.
o
Monogenea ( Hakensaufwrmer)
Posthodiplostomum cuticola
o
Trematoda (Saufwrmer)
!
!
!
Crustacea
Dactylogyrus spec.
Vierzipfliger Kopf
Vier Augen
Monogenea ( Hakensaugwrmer)
Monogenea ( Hakensaugwrmer)
Mollusca (Weichtiere)
Myxozoa
Meist in Cysten
Bucephaloidae
Am Kiemenbogen
Trematoden-Larven (Saugwrmer)
Thylodelphis clavata
Im Glaskrper
Sehr zappelig
Lnglicher Krperbau
Kalkeinschlsse lnglich
Trematoden (Saugwrmer)
Diplostomum spec.
In der Linse
Kalkeinschlsse rund
Trematoden ( Saugwrmer)
!
!
!
!
Philometra spec.
Leibeshhle
Rtlicher Nematode(Fadenwrmer)
Paradilepis scolencia
Leber
Wenige mm gro
Ligula intestinalis
Bandartige Cestodenlarve
Bucephalus polymorphus
Trematoden
Caryophyllaeus laticeps
Nelkenartiger Kopf
Cestoden (Bandwrmer)
Camallanus lacustris
Typische Kopkapsel
Nematoden ( Fadenwrmer)
Pomphorhynchus laevis
Gelb gefrbt
Acanthocephalen (Kratzwrmer)
Myxidum spec.
Niere
Myxozoa
Sphaerospora spec.
Niere
Runde Sporen
Schwimmblase untersuchen
Anguillicola crassus
Nematoden (Fadenwrmer)
Zustandsparameter:
Variablen:
o
= Fischlnge in [cm]
P = 100%
Variablen:
o
W(inf)
W(i)
n(i)
p(i)
!
!
Messmethoden im Freiland (20.6.2012)
Chlorophyllfluoreszenz
Erscheinung, dass nach der Anregung die absorbierte Energie in Form von
langwelligem Licht wieder abgegeben wird
Quenching:
3. Durch Fluoreszenz F
Wirkung ist messbar, da die Chlorophylle der Pflanze eine erhhte Fluoreszenz
zeigen
Stressindikatoren:
Photosynthese allgemein:
Ablaufende Prozesse:
ATP-Bildung ( Photophosphorylierung)
Normalbedingungen :
o
Fluorometer:
Junior PAM
Fluoreszenzparameter:
o
Sttigungsimpulsmethode
ETR =
Fluoreszenzbildanalyse : Anwendungsbeispiele
Beobachtungen:
!
!
Kartiermethoden im
Freiland (27.6.2012)
Faunistische
Untersuchungen am
Beispiel des kosystems
Fliegewsser:
1. Schritt: Habitatkartierung:
Kartierung aller im Bereich der Probestelle vorkommenden Habitate
o
o
Feldprotokollbeispiel:
Abschtzung der
Deckungsgrade vorkommender
Substrattypen
Bemerkungen:
Mineralische Substrate:
Megalithal
o
> 40 cm
Makrolithal:
o
> 20 cm 40 cm
Mesolithal:
o
> 6 cm 20 cm
Faustgroe Steine
Mikrolithal:
o
> 2cm 6 cm
Grobkies
Akal:
o
> 0,2 cm 2 cm
Psammal / Psammopelal
o
> 6 m 2mm
Argyllal
o
< 6 m
Knstliche Substrate:
Technolithal 1
o
Steinschttungen
Technolithal 2
!
Organische Substrate:
Algen
o
Submerse Makrophyten
o
Emerse Makrophyten
o
Xylal ( Holz)
o
CPOM
o
FPOM
o
Debris
!
2. Schritt : Beprobung
Basierend auf der Abschtzung des Deckungsgrades wird die Zahl der Teilproben fr
jeden Substrattyp bestimmt
Beispeil:
!
!
!
!
!
!
!
!
3. Schritt:
Sortierung und Abschtzung der Hufigkeiten
Individuenzahl der klar unterscheidbaren Taxa werde gezhlt und auf die
Gesamtprobe hochgerechnet
Vegetationsaufnahme:
!
!
!
1. Schritt: Flche
Die Gre der Untersuchten Flche richtet sich nach den untersuchten Pflanzen
2. Schritt: Pflanzenliste
!
!
!
!
Deckungsgrade:
!
!
!
!
!
!
!
!
!
!
!
!
!
!
!
Statische Auswertung
Vegetationskundlicher und
faunischer Daten
Man unterscheidet:
!
!
!
!
!
!
oQuantitative Artenliste ( Angaben zur
Individuenzahl, Abundanz = Individuen/Flche)
!
!
!
!
!
Diversittsberechnung:
Kennwerte einer einzelnen Artenliste:
Artenzahl
Diversitt:
Shannon-Wiener-Index:
Ds-w =
ln ()
Bsp:
Taxon
A (Gesamtzahl)
Art 1
Art 2
Art 3
10
Summe
19
!
o
Hoch wenn viele Arten vorkommen und alle Arten hnlich Hufig sind
Margalef-Index:
o
i= Arten
Bsp.:
Taxon
Art 1
Art 2
Art 3
10
Summe
19
!
!
Vergleich von mehreren Artenlisten:
Man unterscheidet:
Arten Identitt: Welche Arten kommen nur in einer Probe vor, welche Arten
kommen in beiden Proben vor?
Varibalen:
o
JAC =
Bsp:
Taxon
Art 1
Art 2
Art 3
JAC = = 0,33
SOR=
Taxon
Gesamt
Art 1
200 (0,88)
65
(0,49)
265
Art 2
25 (0,11)
65
(0,49)
90
Art 3
1
(0,004)
(0,016) 3
Art 4
1
(0,004)
--
Art 5
1
(0,004)
--
Summe
228
132
360
!
!
!
i = Arten
Bsp:
Beim Vergleich nimmt man nur die niedrige Hufigkeit (min) und addiert diese !